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» 中國醫藥研究所
   å‰µç«‹æ–¼1975年，招收碩士班研究生。1988年成立博士班。
   http://www2.cmu.edu.tw/%7Ecmed/cmccms/

» 中西醫結合研究所
   1998年成立，次年開始招生，招收國內、外醫學系學士學位且持有醫師、中醫師或牙醫師證書者，並經教學醫院臨床二年以上。
   http://www2.cmu.edu.tw/%7Ecmed/cmccacwa/

» 中醫學系
   å‰µç«‹æ–¼1966年，修業六年，中西醫兼修；從第二屆開始改為七年，畢業後參加中、西醫師檢覈考試。
   http://www2.cmu.edu.tw/%7Ecmed/chimed/

» 中醫學院
   å‰µæ ¡è¿‘五十年，於2003年升格為醫藥大學，本院包括中醫學系、學士後中醫學系、中國醫學研究所、中西醫結合研究所以及針灸研究所。
   http://www2.cmu.edu.tw/%7Ecmed/cmed/

» 學士後中醫學系
   1984年創設本系。2003年本校改制大學，本系歸屬於中醫學院。
   http://www2.cmu.edu.tw/%7Ecmed/spbcm/

» 針灸研究所
   2005年創立，主要目的是培養針灸師資及專門研究人才為主。
   http://www2.cmu.edu.tw/%7Ecmed/cmugias/